DICOM TO STL (ПЕРЕВОД МРТ ИЛИ КТ В 3D-МОДЕЛЬ)

Подписаться на 3Dtoday
Studia3D
Идет загрузка
Загрузка
13.03.18
4427
24
печатает на PICASO Designer PRO 250
Техничка
34
Есть несколько программ перевода снимков МРТ или КТ в 3d-модель. Для создания трехмерной модели из снимков формата .dcm мы используем InVesalius. Данная программа не только удобна и проста в применении, также доступна для большинства платформ: Windows, Mac OS и т.п. Программа бесплатна и распространяется в открытом доступе.

После установки и открытия программы мы попадаем в главное меню. Где необходимо загрузить наши исходные снимки DICOM.
b32414d4d3d2d0bed1ea1b7032e0c1fc.png
Выбираем наш проект и нажимает кнопку «открыть».
00e5836261da916e79f5b45b88e11e99.png
Ждем процесс загрузки всех изображений.
37e155800aa3a85dbed919744a0d7ed8.png
После загрузки выбираем наш проект и нажимаем на кнопку «импорт».
f56fd32c7c782d889579281449d98106.png
Если на Вашем компьютере недостаточно оперативной памяти, программа предложит уменьшить исходное разрешение изображений.
05bf34a6b69cfc6c90f36d89c4057bd8.png
После импорта мы увидим окно с изображениями нашей томографии. Во втором окне необходимо будет отрегулировать области, которые мы хотим перенести в 3D-модель.
4d0396eea5510727e56e8ca49723fb21.png
В третьем окне нам необходимо создать новую поверхность.
4a5962ef981b329cb00615ab118d7b6e.png
Эта поверхность и будет каркасом нашей будущей модеди. Даем ей название.
ed0bc195727847fc11a253dab13c518d.png
Как видим в нижнем правом углу появилась наша трехмерная модель.
d7165fb7cb8c2cc7d9ddf3acc8005530.png
Нам остается пройти в четвертое окно и экспортировать 3D-поверхности.
0689bfebdb2b5605b71663a9a93090ed.png
Даем название файлу и сохраняем его.
9e78680ae0e86b163ff2ca90d6500a8d.png
Проверим результат в MeshMixer.
6d01a310cbac961c6b6a65e5433c0ec8.png
e5af2f1dfbd976006577691dfe8e49a6.png
d1423e19987f1727dd4aac69fac2a8a7.png
Подписаться на 3Dtoday
34
Комментарии к статье

Комментарии

13.03.18 в 13:28
1
Крутяк
13.03.18 в 15:28
0
Где надыбать мрт недорого !?
13.03.18 в 23:00
0
rep-rap
13.03.18 в 16:09
3
Крутяк даже не в том, что можно VHN-снимки превратить в STL...
Крутяк в том, что МРТ - это можно сказать идеальный 3D-сканер... : )))
13.03.18 в 19:40
0
да это вообще КРУТИЗНА! собственно именно медицинская сторона 3д печати и побудила меня к изучению 3д принтеров и систем материализации,единственным косяком было только сканирование ,все размышлял как МРТ привинтить к принтеру,а оно оказывается "вон чего,Михалыч",не зачем изобретать велосипед...самая сложная часть в любом протезировании-скан сохранившихся фрагментов(для создания более точного сим-мех-биота).кроме того это широчайшая перспектива для ремонта скелетной системы человека путем замены отдельных узлов.
ПЫСЫ...на картинках скелет собаки?8)
13.03.18 в 20:48
0
спасибо!
13.03.18 в 21:15
0
Как-то занимался тем же направлением.
Знающие люди говорят что такие модели позволяют планировать операции, существенно сокращая время оперативного вмешательства. Кроме того можно изготовить специальные кондукторы для операций. Пример печати. Некоторые дефекты скелета человека невозможно рассмотреть на КТ или МРТ, поэтому печатается трехмерная модель для изучения.
Япония давно уже занимается такой технологией.

ae730d1620b4b66a87a4394f6a898938.jpg

5601713f406b1c8f0bcf11a3007b2397.jpg

46e6b95e67018b740d64ea596b6293f4.jpg
29.07.18 в 09:32
0
вот примеры изготовленные для выставки http://3dtoday.ru/we-print/innoprom-2018/ в том числе кондукторы

13.03.18 в 23:03
0
Помню сериал смотрели, про американских врачей (русское название почему-то "анатомия страсти") Так вот там был пациент с очень сложной опухолью. Проблема в том была, что невозможно было ее полнполно увидеть. Так они прямо в больнице напечатали ее на 3д принтере, и потом врачи на ней тренировались. После чего сделали операцию частично в слепую, наощупь. Человек был спасен.

Прикиньте, в одной больнице был томограф и 3д принтер. Промышленного уровня. Мы так жить не скоро будем...
14.03.18 в 11:46
0
будем и очень скоро...
20.03.18 в 05:36
0
Вы переезжаете в Америку?
14.03.18 в 07:39
0
Примерно 3-4 года назад я уже этим занимался. Именно в обозначенной программе (на тот момент у нее был только латинский интерфейс).
Все выглядит красиво, но есть одна проблема - поскольку МРТ делается послойно, то между соседними снимками есть некоторое расстояние.
Знакомый диагност тогда мне принес МРТ-снимок пластикового кожуха для автобагажника - левый (или правый, не помню) потерялся и нужно было напечатать зеркальный. Снимок он принес в максимальном для их МРТ-аппарата разрешении и при конвертации в 3Д выяснилось, что минимальное расстояние между соседними снимками составляет 1мм (первую модель он принес расстоянием между срезами 6мм). Таким образом, точность по оси срезов составляет от 1мм, что оказалось недостаточным, чтобы 3Д модель без реверс-инжиниринга сразу отправить на печать.
Возможно современные аппараты предлагаю большую точность при меньшем воздействии на тело человека, однако в любом случае стоимость снимка достаточно высока и к тому же ограничена невозможностью сканировать металлические предметы.
14.03.18 в 08:02
0
Возможно современные аппараты предлагаю большую точность при меньшем воздействии на тело человека
Внизу скан, полученной модели в этой программе без каких-либо "ковыряний" в настройках, все настройки по-умолчанию.
3a4cf75c034a3898e43937e445f112fe.jpeg

Все течет и изменяется... технологии не стоят на месте.
Но вы совершенно правы, МРТ и КТ бывают разные, как и рентгенологи, которые их пользуют. ;)
14.03.18 в 08:39
0
Достаточно детальные модели. Возможно и аппарат снимок сделал детальный, и в программе доработали алгоритм сшивки срезов. Когда я занимался этой программой, мне была построена модель со сглаженными ступеньками (как 3Д принтер слоями печатает со ступеньками при большой толщине слоя)
Кстати на сайте программы предлагаемые снимки были в отличном качестве и сшивка поверхностей была замечательной. Так что в первую очередь качество конечной 3Д модели зависит от исходника.
14.03.18 в 09:04
2
Кстати на сайте программы предлагаемые снимки были в отличном качестве и сшивка поверхностей была замечательной.
Модель построена не со снимков с сайта(!), а с первого попавшегося мне под руку исследования КТ, но до смешного это оказалось исследование костей моего знакомого.

Вчера зашел к одному доктору, рассказал про данную программу и он тут же попросил меня сделать 3D модель для детального изучения ее перед хирургическим вмешательством. Я установил на компьютер в его кабинете эту программу, "сварил" в ней модель и он в с безумными глазами изучал все тонкости и нюансы для предстоящей операции. Он был на Седьмом небе от счастья, что может покрутить детально со всех сторон готовую модель...

К слову сказать, это был главный врач большого специализированного медицинского клинического центра. У него есть несколько и МРТ и КТ, и это исследование было сохранено на его компьютере. Никакой специальной подготовки снимков для работы с этой программой не было.

Он как мальчишка, которому Дед Мороз подарил на Новый год долгожданный велосипед, прыгал от удовольствия, глаза горели и предвкушал, как он сейчас со своими докторами будет исследовать и планировать лечение пациентов, и скольких ошибок они смогут избежать в процессе подготовки к самим операциям...

Так что спасибо автору топика. Многие врачи просто не знали о существовании такой программы.
14.03.18 в 11:48
1
вот так и необходимо готовить наших лекарей!
15.03.18 в 15:03
0
Так это было КТ или МРТ? В зубной клинике мне делали КТ (компьютерная томограмма, у них так называется - это рентген с датчиком, который по кругу обходит голову пациента (очень быстро, буквально секунду). Так вот для КТ у них специальная программа для просмотра этих снимков, как раз в 3Д. Сделать из КТ 3Д модель мне не удалось - формат другой.
Кстати для более детального планирования операций некоторые продвинутые хирурги не только 3Д модель делают, но и печатают ее для тренировки.
15.03.18 в 17:53
0
Это было исследование КТ формат файлов DICOM.
29.07.18 в 09:10
0
на данный момент у нас в мед. центре стоит кт с слоем 0,5 мм и разрешением 512*512 и как показала практика это тоже не всегда достаточно, при проведении нейрохирургических операциях на позвоночнике.
17.03.18 в 19:19
0
Прямо сейчас работаем с медиками-кардиохирургами. Задача похожая, только там еще +техническое зрение и сложная сегментация, но это не суть.
Мы используем для этих целей 3D slicer. Алгоритм в целом похожий, только тут возможностей больше (и сложнее). Может кому будет полезно
19.03.18 в 15:30
0
3DSlicer rfr то для простого обывателя не торт. Давно гонялся за такой возможностью.... Прочитал про слайсер и поставил. И давай тестить на КТ своей собаки... Нет, не прокатило. Почему то вешается на фото и ничего не строит.

То что тут описали- ИнВесалиус- просто песня! Все получилось. Тупо на автонастройках. Все понятно, все русское...

Плюсую теме!
19.03.18 в 18:06
0
Тоже занимаюсь печатью моделей органов врачам для тренировок перед операцией и для тренировок молодым хирургам. Конкретно почками.
27.04.18 в 03:52
0
А можно примеры работ?
24.09.18 в 10:25
0
Мы профессионально занимаемся обработкой КТ изображений и созданием stl для 3d печати. И хочу Вас заверить не питайте иллюзий получить хороший результат в автоматическом режиме в программе inVesalius. Да, не спорю нормальную кость молодого человека у Вас получится сделать, но когда дело доходит к оскольчатым переломам в пожилом возрасте, тут уже нужен профессиональный глаз опытного кт рентгенолога, так как это уже творчество с кистью и ластиком по отделению разных тканей. Иногда обработка изображения доходит до 4-5 часов опытным специалистом. МРТ снимки для костей не подходят и используются в редких случаях для визуализации мягких тканей. Мы также надаем услуги обработки изображений с превращением в stl файл за небольшую плату. Все кто хотят создать бизнес или помочь развитию медицины, обращайтесь поможем. емайл uafreelan@gmail.com



e14326a59d58da24df1da66a7558323f.jpg
84f4eabdc5f1f5a565378bc828f0a927.jpg
0a49f6e54bab15264bfbbd1bdd5acc74.jpg
2e8aa924f36086132b524a8e27e6530a.jpg
.
05037d3811ab1e20f01d03569cb8d222.jpg
e14940bf8da30fc206fd3322f7010a25.jpg
b8ca11194a4045faf02f970a13fa3d52.jpg
2ecca7a28b3246bc00d662f853c14b80.jpg

Для написания комментариев, пожалуйста, авторизуйтесь.

Читайте в блогах

Предновогодняя акция от компании Formlabs!

Черная пятница? У нас круче!!!

IDEAL PLM проводит конкурс по проектированию в Solid Edge

Blue Pill & SSD1306, ну очень маленькие.., но 32 бит!

3D принтер Wanhao Duplicator 9/300, 9/400, 9/500 - 12 изменений в модификации MK2

Underwater impeller motor